In de Stuurgroep Markermeer-IJmeer werken verschillende overheden samen met regionale en maatschappelijke partijen aan een toekomstbestendig Markermeer-IJmeer.

De Stuurgroep bestaat uit de provincies Flevoland en Noord-Holland, de Rijksoverheid, de gemeente Edam-Volendam (namens de overige Noordhollandse gemeenten rondom Markermeer-IJmeer), de gemeente Lelystad, gemeente Almere, gemeente Amsterdam en het Hoogheemraadschap Hollands Noorderkwartier (namens de waterschappen rondom Markermeer-IJmeer).